Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ShdO88834 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ShdO88834 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ShdO88834 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ShdO88834 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ShdO88834 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ShdO88834 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ShdO88834 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ShdO88834 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ShdO88834 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ShdO88834 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ShdO88834 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ShdO88834 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ShdO88834 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ShdO88834 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ShdO88834 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ShdO88834 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ShdO88834 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ShdO88834 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ShdO88834 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ShdO88834 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShdO88834 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShdO88834 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShdO88834 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShdO88834 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShdO88834 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShdO88834 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShdO88834 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShdO88834 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShdO88834 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ShdO88834 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShdO88834 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShdO88834 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShdO88834 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShdO88834 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShdO88834 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShdO88834 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShdO88834 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShdO88834 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShdO88834 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShdO88834 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShdO88834 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShdO88834 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShdO88834 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShdO88834 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShdO88834 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShdO88834 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShdO88834 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShdO88834 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ShdO88834 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ShdO88834 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ShdO88834 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShdO88834 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShdO88834 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShdO88834 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShdO88834 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ShdO88834 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShdO88834 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShdO88834 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShdO88834 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShdO88834 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShdO88834 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ShdO88834 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShdO88834 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ShdO88834 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ShdO88834 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ShdO88834 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms