Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hcn2O88703 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hcn2O88703 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms