Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ComtO88587 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ComtO88587 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ComtO88587 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ComtO88587 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ComtO88587 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ComtO88587 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ComtO88587 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ComtO88587 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ComtO88587 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ComtO88587 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ComtO88587 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ComtO88587 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ComtO88587 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ComtO88587 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ComtO88587 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ComtO88587 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ComtO88587 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ComtO88587 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ComtO88587 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ComtO88587 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ComtO88587 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ComtO88587 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ComtO88587 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ComtO88587 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ComtO88587 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ComtO88587 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ComtO88587 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ComtO88587 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ComtO88587 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ComtO88587 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ComtO88587 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ComtO88587 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ComtO88587 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ComtO88587 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ComtO88587 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ComtO88587 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ComtO88587 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ComtO88587 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ComtO88587 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ComtO88587 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ComtO88587 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ComtO88587 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ComtO88587 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ComtO88587 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ComtO88587 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ComtO88587 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ComtO88587 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ComtO88587 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ComtO88587 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ComtO88587 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ComtO88587 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ComtO88587 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ComtO88587 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ComtO88587 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ComtO88587 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ComtO88587 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ComtO88587 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ComtO88587 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ComtO88587 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ComtO88587 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ComtO88587 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ComtO88587 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ComtO88587 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ComtO88587 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ComtO88587 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ComtO88587 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ComtO88587 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ComtO88587 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ComtO88587 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ComtO88587 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ComtO88587 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ComtO88587 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ComtO88587 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ComtO88587 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ComtO88587 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ComtO88587 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ComtO88587 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ComtO88587 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ComtO88587 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ComtO88587 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ComtO88587 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ComtO88587 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ComtO88587 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ComtO88587 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ComtO88587 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ComtO88587 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ComtO88587 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ComtO88587 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ComtO88587 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ComtO88587 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ComtO88587 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ComtO88587 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ComtO88587 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ComtO88587 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ComtO88587 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ComtO88587 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ComtO88587 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ComtO88587 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ComtO88587 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms