Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Kcnk4O88454 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Kcnk4O88454 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Kcnk4O88454 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Kcnk4O88454 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Kcnk4O88454 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Kcnk4O88454 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Kcnk4O88454 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Kcnk4O88454 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Kcnk4O88454 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Kcnk4O88454 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Kcnk4O88454 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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