Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm10509O88255 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms