Protein–RNA interactions for Protein: O70507

Hcn4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn4O70507 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcn4O70507 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms