Protein–RNA interactions for Protein: O70439

Stx7, Syntaxin-7, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx7O70439 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx7O70439 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Stx7O70439 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Stx7O70439 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stx7O70439 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Stx7O70439 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stx7O70439 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stx7O70439 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Stx7O70439 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx7O70439 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Stx7O70439 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Stx7O70439 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx7O70439 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx7O70439 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Stx7O70439 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Stx7O70439 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Stx7O70439 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Stx7O70439 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx7O70439 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Stx7O70439 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx7O70439 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx7O70439 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx7O70439 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx7O70439 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx7O70439 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx7O70439 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx7O70439 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Stx7O70439 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx7O70439 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx7O70439 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Stx7O70439 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx7O70439 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx7O70439 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx7O70439 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx7O70439 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Stx7O70439 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx7O70439 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx7O70439 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Stx7O70439 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Stx7O70439 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx7O70439 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Stx7O70439 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx7O70439 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Stx7O70439 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx7O70439 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx7O70439 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx7O70439 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Stx7O70439 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx7O70439 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx7O70439 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx7O70439 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx7O70439 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx7O70439 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx7O70439 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx7O70439 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx7O70439 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx7O70439 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx7O70439 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx7O70439 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx7O70439 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx7O70439 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx7O70439 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx7O70439 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx7O70439 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx7O70439 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx7O70439 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Stx7O70439 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx7O70439 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx7O70439 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx7O70439 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx7O70439 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx7O70439 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx7O70439 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx7O70439 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx7O70439 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx7O70439 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx7O70439 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx7O70439 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx7O70439 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx7O70439 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx7O70439 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx7O70439 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx7O70439 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx7O70439 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx7O70439 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Stx7O70439 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx7O70439 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx7O70439 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx7O70439 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx7O70439 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx7O70439 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Stx7O70439 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Stx7O70439 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Stx7O70439 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Stx7O70439 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Stx7O70439 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Stx7O70439 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Stx7O70439 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Stx7O70439 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Stx7O70439 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms