Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Foxq1O70220 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Foxq1O70220 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms