Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RngttO55236 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RngttO55236 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RngttO55236 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RngttO55236 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RngttO55236 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RngttO55236 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RngttO55236 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RngttO55236 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RngttO55236 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RngttO55236 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RngttO55236 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RngttO55236 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RngttO55236 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RngttO55236 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RngttO55236 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RngttO55236 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RngttO55236 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RngttO55236 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RngttO55236 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RngttO55236 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RngttO55236 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RngttO55236 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RngttO55236 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RngttO55236 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RngttO55236 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RngttO55236 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RngttO55236 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RngttO55236 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RngttO55236 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RngttO55236 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RngttO55236 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RngttO55236 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RngttO55236 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RngttO55236 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RngttO55236 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RngttO55236 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RngttO55236 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RngttO55236 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RngttO55236 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RngttO55236 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RngttO55236 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RngttO55236 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RngttO55236 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RngttO55236 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RngttO55236 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RngttO55236 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RngttO55236 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RngttO55236 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RngttO55236 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RngttO55236 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RngttO55236 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RngttO55236 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RngttO55236 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RngttO55236 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RngttO55236 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RngttO55236 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RngttO55236 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RngttO55236 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RngttO55236 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RngttO55236 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RngttO55236 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RngttO55236 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RngttO55236 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RngttO55236 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RngttO55236 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RngttO55236 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RngttO55236 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RngttO55236 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RngttO55236 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RngttO55236 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RngttO55236 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RngttO55236 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RngttO55236 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RngttO55236 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RngttO55236 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RngttO55236 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RngttO55236 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RngttO55236 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RngttO55236 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RngttO55236 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RngttO55236 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RngttO55236 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RngttO55236 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RngttO55236 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RngttO55236 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RngttO55236 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RngttO55236 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RngttO55236 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RngttO55236 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RngttO55236 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RngttO55236 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RngttO55236 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RngttO55236 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RngttO55236 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RngttO55236 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RngttO55236 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RngttO55236 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RngttO55236 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RngttO55236 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms