Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Dsg2O55111 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Dsg2O55111 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Dsg2O55111 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Dsg2O55111 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Dsg2O55111 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dsg2O55111 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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