Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Syngr2O55101 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Syngr2O55101 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms