Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bnip3O55003 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bnip3O55003 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bnip3O55003 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bnip3O55003 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bnip3O55003 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bnip3O55003 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bnip3O55003 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bnip3O55003 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bnip3O55003 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bnip3O55003 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bnip3O55003 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bnip3O55003 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bnip3O55003 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Bnip3O55003 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bnip3O55003 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bnip3O55003 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bnip3O55003 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bnip3O55003 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Bnip3O55003 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bnip3O55003 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bnip3O55003 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bnip3O55003 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bnip3O55003 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bnip3O55003 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bnip3O55003 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms