Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3O54890 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms