Protein–RNA interactions for Protein: O54836

Zmat3, Zinc finger matrin-type protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat3O54836 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zmat3O54836 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms