Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffaO54786 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffaO54786 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffaO54786 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffaO54786 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffaO54786 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffaO54786 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffaO54786 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffaO54786 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffaO54786 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffaO54786 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DffaO54786 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffaO54786 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DffaO54786 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DffaO54786 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffaO54786 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffaO54786 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffaO54786 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffaO54786 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffaO54786 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffaO54786 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffaO54786 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffaO54786 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffaO54786 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffaO54786 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffaO54786 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DffaO54786 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DffaO54786 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DffaO54786 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DffaO54786 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DffaO54786 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DffaO54786 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DffaO54786 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DffaO54786 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DffaO54786 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DffaO54786 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DffaO54786 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
DffaO54786 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DffaO54786 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DffaO54786 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DffaO54786 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DffaO54786 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DffaO54786 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DffaO54786 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DffaO54786 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DffaO54786 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DffaO54786 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DffaO54786 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DffaO54786 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DffaO54786 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DffaO54786 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DffaO54786 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DffaO54786 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DffaO54786 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DffaO54786 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DffaO54786 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DffaO54786 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffaO54786 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffaO54786 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffaO54786 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffaO54786 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffaO54786 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffaO54786 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffaO54786 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffaO54786 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffaO54786 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffaO54786 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffaO54786 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffaO54786 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffaO54786 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffaO54786 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffaO54786 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffaO54786 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffaO54786 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffaO54786 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffaO54786 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffaO54786 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffaO54786 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffaO54786 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffaO54786 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DffaO54786 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffaO54786 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffaO54786 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffaO54786 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffaO54786 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffaO54786 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffaO54786 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffaO54786 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DffaO54786 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffaO54786 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffaO54786 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffaO54786 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffaO54786 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffaO54786 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffaO54786 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffaO54786 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffaO54786 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DffaO54786 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DffaO54786 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DffaO54786 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms