Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limk2O54785 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Limk2O54785 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limk2O54785 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limk2O54785 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Limk2O54785 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limk2O54785 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limk2O54785 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Limk2O54785 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limk2O54785 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limk2O54785 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Limk2O54785 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Limk2O54785 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limk2O54785 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Limk2O54785 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Limk2O54785 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Limk2O54785 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Limk2O54785 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Limk2O54785 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Limk2O54785 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limk2O54785 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limk2O54785 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limk2O54785 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limk2O54785 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Limk2O54785 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Limk2O54785 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limk2O54785 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limk2O54785 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Limk2O54785 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limk2O54785 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Limk2O54785 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limk2O54785 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limk2O54785 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limk2O54785 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limk2O54785 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limk2O54785 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limk2O54785 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limk2O54785 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limk2O54785 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limk2O54785 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Limk2O54785 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limk2O54785 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limk2O54785 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limk2O54785 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limk2O54785 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limk2O54785 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Limk2O54785 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limk2O54785 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limk2O54785 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Limk2O54785 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Limk2O54785 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limk2O54785 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Limk2O54785 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Limk2O54785 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limk2O54785 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limk2O54785 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limk2O54785 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limk2O54785 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limk2O54785 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limk2O54785 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limk2O54785 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limk2O54785 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Limk2O54785 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limk2O54785 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limk2O54785 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Limk2O54785 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limk2O54785 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Limk2O54785 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Limk2O54785 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Limk2O54785 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms