Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaluO35887 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaluO35887 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaluO35887 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaluO35887 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaluO35887 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CaluO35887 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaluO35887 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaluO35887 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaluO35887 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaluO35887 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaluO35887 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CaluO35887 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaluO35887 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaluO35887 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaluO35887 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaluO35887 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaluO35887 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaluO35887 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaluO35887 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaluO35887 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaluO35887 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaluO35887 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaluO35887 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaluO35887 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaluO35887 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaluO35887 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CaluO35887 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaluO35887 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CaluO35887 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaluO35887 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaluO35887 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaluO35887 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaluO35887 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CaluO35887 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaluO35887 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaluO35887 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaluO35887 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaluO35887 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaluO35887 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaluO35887 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaluO35887 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaluO35887 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaluO35887 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaluO35887 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaluO35887 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaluO35887 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaluO35887 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaluO35887 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaluO35887 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaluO35887 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaluO35887 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaluO35887 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaluO35887 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaluO35887 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaluO35887 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaluO35887 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaluO35887 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaluO35887 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaluO35887 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaluO35887 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaluO35887 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaluO35887 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaluO35887 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaluO35887 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaluO35887 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CaluO35887 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms