Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc27a2O35488 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc27a2O35488 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc27a2O35488 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc27a2O35488 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms