Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Abcc1O35379 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Abcc1O35379 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms