Protein–RNA interactions for Protein: O35218

Cpsf2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf2O35218 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpsf2O35218 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cpsf2O35218 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms