Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr1aO35134 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr1aO35134 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms