Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scarb2O35114 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Scarb2O35114 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Scarb2O35114 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Scarb2O35114 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Scarb2O35114 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Scarb2O35114 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Scarb2O35114 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Scarb2O35114 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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