Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Cldn4O35054 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Cldn4O35054 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Cldn4O35054 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Cldn4O35054 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cldn4O35054 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cldn4O35054 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cldn4O35054 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cldn4O35054 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cldn4O35054 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn4O35054 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn4O35054 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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