Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MsmbO08540 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MsmbO08540 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MsmbO08540 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MsmbO08540 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
MsmbO08540 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
MsmbO08540 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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