Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm17078M0QW51 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm17078M0QW51 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm17078M0QW51 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm17078M0QW51 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm17078M0QW51 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm17078M0QW51 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm17078M0QW51 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm17078M0QW51 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17078M0QW51 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms