Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20878L7N244 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm20878L7N244 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms