Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3542K7N6U2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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