Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc191J3QQ27 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms