Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Gm379J3QQ19 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Gm379J3QQ19 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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Gm379J3QQ19 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Gm379J3QQ19 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Gm379J3QQ19 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Gm379J3QQ19 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Gm379J3QQ19 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Gm379J3QQ19 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm379J3QQ19 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm379J3QQ19 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm379J3QQ19 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm379J3QQ19 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm379J3QQ19 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm379J3QQ19 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm379J3QQ19 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm379J3QQ19 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm379J3QQ19 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm379J3QQ19 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm379J3QQ19 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm379J3QQ19 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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