Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC1

Gm933, Predicted gene 933, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm933J3QPC1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm933J3QPC1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms