Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cldn34c2J3QNM1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cldn34c2J3QNM1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cldn34c2J3QNM1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cldn34c2J3QNM1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn34c2J3QNM1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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