Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Gm21972J3QN38 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Gm21972J3QN38 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Gm21972J3QN38 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Gm21972J3QN38 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Gm21972J3QN38 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm21972J3QN38 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm21972J3QN38 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm21972J3QN38 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm21972J3QN38 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm21972J3QN38 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm21972J3QN38 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm21972J3QN38 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21972J3QN38 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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