Protein–RNA interactions for Protein: J3QMI4

Calhm3, Calcium homeostasis modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm3J3QMI4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Calhm3J3QMI4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calhm3J3QMI4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms