Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21818J3KMS6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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