Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Gm20830J3KML6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Gm20830J3KML6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20830J3KML6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
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