Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Taf4bG5E8Z2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms