Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmn1r58G3X9U3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms