Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna9G3X8Z7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms