Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usp9yF8VPU6 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Usp9yF8VPU6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms