Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Farp1F8VPU2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms