Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm28038F7BCN9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms