Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm8005F6YKY3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm8005F6YKY3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms