Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf4E9QAP7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf4E9QAP7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms