Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms