Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Myo5cE9Q1F5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Myo5cE9Q1F5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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