Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20425E9Q035 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20425E9Q035 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms