Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Ddx60E9PZQ1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ddx60E9PZQ1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms