Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Ryr1E9PZQ0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms