Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sbf2E9PXF8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sbf2E9PXF8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms