Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim30bE9PVL6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms